剧情背景设定在全球怪物灾难肆虐的年代，1966年，各国团结成立了地球防卫队（GGF），以应对来自地球内外的怪物和外星生命的袭击。然而，如今人类对自然界的破坏和全球变暖问题日益严峻。在这一背景下，一天晚上，宇宙甲壳怪物巴赞甲现身，地球防卫队的清理行动陷入了困境，比留间弦人领导的特殊部队陷入了绝望之境。

然而，命运的转折点即将来临。一个神秘的巨人，代号为“奥特曼”，降临地球，带着耀眼的光芒。这位身份不明的大型外星人自几十年前就一直被宇航员们传颂。弦人被召唤到指挥中心，接到了成为特殊怪兽对应分遣队（SKaRD）指挥官的任务。SKaRD是一支秘密组织的特殊怪物反应分队，他们驾驶巨型怪物形状的机器人阿斯加隆，来对抗怪物灾难。

同时，弦人还要调查在巴赞甲之战中出现的奥特曼是否是必须消灭的敌人。他毫不犹豫地接受了这项挑战，宣誓要解决这个问题。在布莱泽奥特曼之光的庇佑下，弦人队长将与SKaRD的特殊成员一起，投身到与怪物的新战斗中。他的内心深藏着坚韧的勇气和坚定的正义信念。